HSE大学的研究人员已经成为世界上第一个发现重症遗传易感性的人新型冠状病毒肺炎。研究结果发表在杂志上免疫学前沿。
t细胞免疫是人体对抗病毒感染的关键机制之一。细胞免疫发展的分期基础是病毒多肽在被感染细胞表面的呈现。随后,T淋巴细胞被激活,开始杀死被感染的细胞。成功呈现病毒多肽的能力在很大程度上取决于遗传。在人类细胞中,人类白细胞抗原I类(HLA-I)分子负责这种表现。这六种分子在每个人身上都是独一无二的,它们从每个人的父母那里遗传而来。简单地说,如果这组等位基因能很好地检测到病毒,那么免疫细胞就会很快地检测到并摧毁被感染的细胞;如果一个人有一组不善于检测的基因,那么更严重的疾病就更有可能被观察到。
HSE的生物学和生物技术的研究人员——马克西姆Shkurnikov斯捷潘yabo124Nersisyan,阿列克谢Galatenko和亚历山大Tonevitsky——与同事一起从Pirogov俄罗斯国家研究医科大学和Filatov城市临床医院(Tatjana Jankevic,伊凡Gordeev,瓦莱里·Vechorko)研究HLA-I基因型之间的互连和COVID-19的严重程度。
他们利用机器学习建立了一个模型,该模型提供了对COVID-19 t细胞免疫反应可能能力的整体评估:如果HLA-I等位基因集允许有效地呈现SARS-CoV-2病毒肽,这些个体获得低风险评分,而较低表达能力的人获得较高的风险评分(范围从0到100)。为验证该模型,对100余例COVID-19患者和400余名健康人(对照组)的基因型进行分析。结果表明,模型风险评分在预测COVID-19严重程度方面非常有效。
除了分析莫斯科人口,研究人员还将他们的模型用于西班牙马德里的病人样本。在该独立样本上也证实了高预测精度:COVID-19重症患者的风险评分明显高于中轻病例患者。
“除了发现基因型与COVID-19严重程度之间的相关性外,建议的方法还有助于评估COVID-19的某种突变如何影响t细胞对病毒免疫的发展。例如,我们将能够检测到感染SARS-CoV-2新毒株可能导致更严重疾病的患者群体,”Alexander Tonevitsky说。
参考文献:Maxim Shkurnikov、Stepan Nersisyan、Tatjana Jankevic、Alexei Galatenko、Ivan Gordeev、Valery Vechorko和Alexander Tonevitsky于2021年2月23日发表的《HLA I类基因型与冠状病毒疾病-19严重程度的关系》免疫学前沿。
DOI: 10.3389 / fimmu.2021.641900
第一个发表评论关于“俄罗斯研究人员发现的重症COVID-19遗传易感性”