在癌症基因组的“暗物质”中发现的高度复发突变

人黑色瘤 - 细胞

描绘了在组织培养中生长的人黑色素瘤细胞系。诸如此类的癌细胞系的研究允许科学家调查癌症细胞生物过程和改变它们以设计和测试新治疗的方法。Dlumen / iStock的图像

发现两个新发现的Tert启动子突变比黑素瘤中的BRAF突变更常见,统称在71%的黑色瘤中检查。

在科学家称之为癌症基因组的“暗物质”中发现了两个突变,统称在71%的恶性黑素瘤肿瘤中,以前尚未发现癌症相关的突变。

在1月24日发出的科学表达问题上报告他们的调查结果,哈佛医学院(HMS)在广泛研究所的Dana-Farber癌症研究所和研究人员中的研究人员表示,在许多人的肿瘤中出现的高度“反复性”突变 - 可能是发现迄今为止发现的黑色素瘤细胞中最常见的突变。

研究人员表示,这些癌症相关的突变是第一个在广阔地区发现的脱氧核糖核酸在不含蛋白质的癌细胞中的癌细胞。突变位于非蛋白质编码DNA中,该DNA调节基因的活性。

这种非编码DNA,其中许多是以前被驳回为“垃圾”的占细胞基因组的99%。在过去数十年中已经确定了大量癌症致癌突变,但在实际的遗传蓝图中发现了蛋白质的实际遗传蓝图。

“这个新发现代表了癌症基因组的”暗物质“的初始遗传,”Hami Garraway,HMS副教授和文章的高级作者。

“此外,这代表了两种最常见的黑素瘤基因突变的发现。作为一个整体,这两个Tert启动子突变甚至比黑素瘤中的BRAF突变更常见。Garraway表示,这一发现可能导致我们更加创造地思考靶向癌症或预防培训的益处。“

突变影响启动子区域 - 一种调节基因表达的DNA代码的延伸。TERT包含用于使端粒酶逆转录酶的配方,一种可以使细胞几乎不朽的酶,并且通常在癌细胞中发现过表达。DNA的启动子区域控制基因转录的速率 - 将其DNA配方复制到细胞用于制造蛋白质的消息中。

“我们认为启动子区域中的这些突变可能是一种方式可以是一种方式可以激活TERT基因,”富兰克林·黄,医学中的HMS临床研究员和哈佛M.D.-PH.D。学生eran hodis。

为了研究突变的效果,研究人员将突变叔促进剂钩为使荧光素酶,发光蛋白质的基因钩。他们观察到突变启动子在实验室细胞系中增加了荧光素酶的产生。以同样的方式,科学家认为,人着色素皮肤细胞中的突变启动子可以将TERT基因发送到过载,可能导致黑素瘤的发育。

当科学家们通过来自恶性黑素瘤肿瘤的全基因组测序的数据筛选时发现了突变。与“全外”搜索仅检查细胞基因组的蛋白质编码DNA,全基因组搜索扫描所有DNA,包括非编码区。

在分析全基因组数据时,研究人员发现了两种体细胞或未遗传的突变,17%(89%)的肿瘤。接下来,它们测序较大数量的黑素瘤肿瘤,发现两个突变总共以71%的肿瘤存在。

研究人员表示,来自其他一些恶性肿瘤的细胞系中存在相同的突变,并且初步证据显示它们在膀胱和肝癌中可能异常常见。他们还注意到发现以前没有与癌症改变相关的DNA中这些重要突变的发现突出了肿瘤DNA全基因组搜索的价值。

其他提交人包括哈佛医学院的一名学生玛丽珏徐;Gregory V. Kryukov广泛;和MD安德森癌症中心的Lynda Chin。

该研究得到了国家卫生大学研究所,Mittelman家庭团契,美国癌症协会,诺华生物医学研究机构,黑素瘤研究联盟和STARR癌症联盟的核心机构。

出版物:富兰克林W.Huang,Eran Hodis,Mary Jue Xu,Gregory V.Kryukov,Lynda Chin,Levi A.Garraway,“人体黑素瘤的高度复发性Tert启动子突变”,Science(2013);DOI:10.1126 / Science.1229259

图片:Dlumen / iStock

是第一个评论在癌症基因组的“暗物质”中发现的“高度复发性突变”

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