Igenomics:世界上第一个在口袋里的DNA“Tricorder”

aspyn palatnick

Aspyn Palatnick在寒春港实验室的125周年纪念公寓举行了世界上第一个移动遗传学实验室。新的iPhone应用程序,IGENOMICS,DNA分析仪和牛津纳米孔的USB大小的组合,DNA测序仪,使基因组分析便携和可访问。信用:CSHL.

冷泉港实验室(CSHL)科学家们开发了世界上第一个移动基因组序列分析仪,一个名为Igenomics的新款iPhone应用程序。通过用手持设备配对iphone脱氧核糖核酸序列仪,用户可以创建一个移动遗传学实验室,让人想起星际迷航中的“三角机”。IGENOMICS应用程序完全在IOS设备上运行,减少了对该领域的笔记本电脑或大型设备的需求,这对于大流行和生态工人有用。Aspyn Palatnick在CSHL兼职的Igenomics中的Igenomics Michael Schatz的实验室教授,在八年后,他是一名14岁的高中实习生。

IPhone应用程序是开发的,以补充牛津纳米莫博士的微小DNA测序装置。Palatnick现在在Facebook上的软件工程师在加入Schatz实验室时已经在建立iPhone应用程序时经历过。他和Schatz意识到:

“随着测序者继续变小,没有技术可以让您在移动设备上学习DNA。大多数研究DNA:对齐,分析,在大型服务器集群或高端笔记本电脑上完成。“

Aspyn Palatnick 2013.

2013年,15岁的Aspyn Palatnick学习Michael Schatz在迈克尔Schatz的实验室基因组分析基础知识。学分:CSHL

Schatz认识到科学家学习Pandemics的“穿着纳米孔和笔记本电脑和其他服务器的手提箱飞行,以便在远程领域进行分析。”Igenomics通过使基因组研究更具便携,可访问,可负担得起的帮助。

用户可以通过彼此进行排序数据,使DNA分析能够在最远程位置 - 即使没有互联网访问。Schatz描述了Igenomics甚至可能进入宇航员手中的方式:

“在太空中进行DNA测序有很多兴趣。我想看看是否有办法我们可以在那里获得iGenomics。有很多人有兴趣做到这一点。这是一个真实证明,你知道如何做到的是常规计算机的任何分析。带给你的是不可能的。“

在杂志中傻桥,Palatnick和Schatz报告IGENOMICS算法可以快速映射病毒病原体的DNA序列,例如流感病毒或ZIKA病毒,并鉴定诊断和治疗的重要突变。他们还提供了一个用于分析其他病毒基因组的在线教程,例如来自aSARS-CoV-2病人。

Schatz梦想这个设备将有助于现场工人和公民科学家的人:

“今天,我们都在我们的口袋里携带专业的相机,所以在接下来的几年里,我们都在难以想象的是,我们也在我们的智能手机上携带自己的DNA序列。只有这么多机会来进行环境测量并寻找病原体,甚至可能扫描自己。“

参考:“IGENOMICS:智能手机综合DNA序列分析”由Aspyn Palatnick,Bin Zhou,Elodie Ghedin和Michael C Schatz,192020年12月7日,傻桥
DOI:10.1093 /吉祥/ GIAA138

1条评论在“Igenomics:世界上第一个DNA”Tricorder“在你的口袋里”

  1. 再会
    我需要更多关于Igenomics的信息。
    这个成本是多少,它是如何工作的。

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