麻省理工学院的Covid-19基于新的CRISPR型快速测试显示了改善的灵敏度

SARS-CoV-2电子显微镜图像

扫描电子显微镜图像显示SARS-CoV-2(圆形金物体)从实验室培养的细胞表面出现。信贷:NIAID-RML

一项基于crispr的测试在麻省理工学院而广泛的研究所可以检测到标准CoVID-19诊断的几乎和案例接近。

自Covid-19大流行开始以来,麻省理工学院、麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的研究人员以及他们在华盛顿大学美国布里格姆和妇女医院(Brigham and Women 's Hospital)、弗雷德·哈钦森癌症研究中心(Fred Hutchinson Cancer Research Center)和拉根研究所(Ragon Institute)一直在研究一种基于crispr的Covid-19诊断方法,可以在30分钟到一个小时内产生类似的结果精度作为现在使用的标准PCR诊断方法。

这种被称为STOPCovid的新测试仍处于研究阶段,但原则上,它的制造成本足够低,人们可以每天进行自我测试。一项研究今天发表在新英格兰医学杂志研究人员表示,在一组患者样本上,他们的检测发现了93%的Covid-19阳性病例。

“我们需要快速测试,成为这种情况的部分面料,以便人们每天都能测试自己,这将减缓爆发,”莫尔·阿巴德·研究诊断,奥马尔·阿卜杜勒省说。

COVID - 19快速测试步骤

:将鼻拭子浸入含有裂解缓冲液和磁珠的提取缓冲液中。在室温下10分钟后,将样品放在磁铁上,抽吸提取缓冲液。将STOPCovid反应添加到小球中,并将样品加热到60℃。对于横向流动读数,80分钟后,检测条浸入反应中。对于荧光读数,45分钟后,可以使用荧光阅读器解释反应。资料来源:研究人员提供

Abudayyah是这项研究的资深作者之一,其他的还有麦戈文研究员Jonathan Gootenberg、麻省理工学院麦戈文研究所和霍华德休斯医学研究所布罗德研究所的核心成员Feng Zhang,以及麻省理工学院詹姆斯和帕特里夏普瓦特拉斯63号神经科学教授。这篇论文的第一作者是麻省理工学院生物工程研究生Julia jung和Alim Ladha,他们在Zhang实验室工作。

简化测试

疫情发生后不久,张志军的实验室就开始与Abudayyeh和Gootenberg实验室合作开展Covid-19诊断工作SARS-CoV-2爆发开始了。他们专注于进行一种名为STOPCovid的分析,这种分析操作简单,不需要任何专门的实验室设备。他们希望,这样的测试将来能够在诸如医生办公室、药房、疗养院和学校等即时护理场所中使用。

jung说:“我们开发了STOPCovid,这样所有事情都可以在一个步骤中完成。“一个简单的步骤意味着测试可能会由非专家在实验室环境之外进行。”

STOPCovid设备

这张照片显示了运行STOPCovid所需的设备和消耗品。资料来源:研究人员提供

在今天报道的新版STOPCovid中,研究人员采用了一个过程,通过添加具有吸引力的磁珠,将病毒遗传物质浓缩到患者样本中核糖核酸这样就不需要昂贵的净化设备,因为这些设备费时费力,而且由于需求高而供应不足。这一浓缩步骤提高了检测的灵敏度,现在已接近PCR。

“一旦我们把病毒基因组放到珠子上,我们发现这可以使我们达到非常高的灵敏度,”古滕贝格说。

与合作者基斯杰罗姆·弗雷德哈钦森癌症研究中心和亚历克斯Greninger华盛顿大学,研究人员测试STOPCovid积极402患者样本- 202和200 - - -发现新的测试检测到阳性病例的93%由CDC PCR测试的标准。

拉达说:“看到stopcovid19在实际患者样本上工作,我真的很高兴。”

他们还与布里格姆与妇女医院(Brigham and Women 's Hospital)的安·伍利(Ann Woolley)和黛布·洪(Deb Hung)合作,表明stopcovid19测试对使用侵袭性较低的前鼻孔拭子采集的样本有效。他们现在用唾液样本来测试,这使得在家测试更加容易。研究人员正在继续开发这项测试,希望能将其交付给最终用户,帮助他们对抗新型冠状病毒肺炎大流行。

“目标是使这款测试易于使用和敏感,因此我们可以判断某人是否尽早携带病毒,”张说。

参考文献:《用SHERLOCK One-Pot Testing检测SARS-CoV-2》,Julia jung, B.S.;阿利姆Ladha,本科;Makoto Saito博士;Nam-Gyun金博士。Ann E. Woolley,医学博士,公共卫生硕士;迈克尔·席格博士;罗伯特P.J.巴雷托博士;Amardeep Ranu,本科;Rhiannon K. Macrae博士;Guilhem福尔博士; Eleonora I. Ioannidi, B.S.; Rohan N. Krajeski, B.S.; Robert Bruneau, B.S.; Meei-Li W. Huang, Ph.D.; Xu G. Yu, M.D.; Jonathan Z. Li, M.D.; Bruce D. Walker, M.D.; Deborah T. Hung, M.D., Ph.D.; Alexander L. Greninger, M.D., Ph.D.; Keith R. Jerome, M.D., Ph.D.; Jonathan S. Gootenberg, Ph.D.; Omar O. Abudayyeh, Ph.D. and Feng Zhang, Ph.D., 16 September 2020,新英格兰医学杂志
DOI: 10.1056 / NEJMc2026172

这项研究由美国国家卫生研究院、瑞士国家科学基金会、帕特里克·j·麦戈文基金会、麦戈文脑研究所、马萨诸塞州病原体准备联盟恒大新冠病毒应对基金、马瑟斯基金会、霍华德·休斯医学研究所、公开慈善项目,J.和P. Poitras,和R. Metcalfe。

1评论关于“麻省理工学院基于crispr的新型COVID-19快速检测显示灵敏度提高”

  1. 很有趣。

    快速检测将不仅是Covid - 19的会阴需求,也是未来人类可能失去的病毒的需求。有能力及早发现可能引起疾病和死亡的病毒、病原体和有害细菌,以便控制这些细菌的生长和传播,这是一项至关重要的需求。人类需要提前计划,采取生活方式来生存,并管理未来可能导致人类灭绝的流行病,这将是现代医学正在勇敢进行的战斗中必不可少的要求。

    然而,正如任何一个好的医生都会告诉他的病人,预防胜于治疗。几乎所有这些反人类的身体不友好的生物进入人体通过九个开口所有人类和人类的生态系统有时未能认识到入侵生物或对外国侵略者的到来后认识到同一晚,造成损害的组织通力试图保护,导致病人过早死亡。因此,不仅测试,甚至消除测试的需求是未来生存的一个关键要求。

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