新的细菌培养方法可能会导致发现多种新的微生物物种

一种新的细菌培养方法

培养以前“不能培养”的细菌的新方法。资料来源:Molina-Menor、Gimeno-Valero、Pereto和Porcar

依赖于培养的研究允许突出塔巴马斯沙漠的令人惊讶的大量不同和以前未报告的细菌菌株。

微生物是地球上最丰富、最多样的生命形式。然而,其中绝大多数仍然未知。事实上,我们星球上只有一小部分微生物可以在传统条件下培养,这就把一个无法培养的微生物世界排除在了我们的范围之外。对于在极端条件下繁殖的细菌来说尤其如此,因为恶劣的条件很难在实验室中重现。虽然已经在撒哈拉沙漠、阿塔卡马沙漠和吉布森沙漠进行了一些微生物研究,但对欧洲干旱地区的研究仍然很少。

为了最终探索一些欧洲沙漠的微生物群落,来自巴伦西亚大学和达尔文生物勘探卓越组织的研究人员在这里研究了半干旱的Tabernas沙漠的细菌多样性。为了实现这一目标,该团队开发了新的细菌培养方法。

塔纳纳斯沙漠

位于西班牙阿尔梅里亚省的半干旱的Tabernas沙漠。资料来源:Molina-Menor、Gimeno-Valero、Pereto和Porcar

“Tabernas Desert的Culturomics是一种罕见,学习的环境之间的理想十字路口,以及简单但强大的培养技术的应用,包括长期孵化时间,稀释的媒体和仔细的殖民地挑选,”曼努埃尔·普科尔博士达尔文·巴伦西亚大学,达尔文生物勘士总统卓越,并将研究的最后作者。

研究人员试验不同的培养方法,以寻找一些不脱除物种的允许条件。它们的策略在组合不同培养基中,使用培养物的连续稀释度(高达百次),并扩展孵育时间(最多一个月)。共有254个细菌菌株。从浓缩介质中分离的大多数物种先前被描述为从其他沙漠中分离的土壤居民或物种。然而,从高度稀释的介质中分离的60%的菌株是未鉴定的并且可能是新的细菌种类。此外,在一个月后,在孵育时间上也允许在一个月后分离一些寡营养菌株(在低营养条件下生活缓慢的细菌),否则在实验室条件下难以生长。

Tabernas沙漠西班牙

位于西班牙阿尔梅里亚省的半干旱的Tabernas沙漠。资料来源:Molina-Menor、Gimeno-Valero、Pereto和Porcar

完全,这项研究突出了从天然样本获得更高的微生物多样性的简单策略的潜力,特别是如果取自极端环境。但塔纳纳斯沙漠的未爆发的细菌生物多样性可能会产生远远超越生态和细菌学:

“我们目前正在鉴定几种未知细菌的特征,其中三种是新的Kineococcus物种。我确信某些细菌菌株可以生产出生物技术相关的产品。进行正确的筛选是很重要的,”Porcar说。

参考:《来自欧洲沙漠的高可培养细菌多样性:Tabernas沙漠》作者:Esther Molina-Menor, Helena Gimeno-Valero, Javier Pascual2, Juli Pereto and Manuel Porcar, 2021年1月8日,微生物学前沿yabo124
DOI: 10.3389 / fmicb.2020.583120

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