新研究突出了慢性感染期间新的Covid突变的风险

COVID突变的概念

SARS-CoV-2在科学家说,在慢性感染的情况下,可以出现类似于B1.1.7英国的突变体变体中的突变。

写在性质剑桥大学(Cambridge)研究人员领导的一个研究小组报告了他们是如何在接受恢复期治疗的免疫缺陷患者中观察到SARS-CoV-2突变的等离子体。特别是,他们看到了在新的变体中看到的关键突变的出现,导致英国被迫再次被迫陷入严格的锁定,尽管没有任何建议,该变异起源于该患者。

使用在实验室中创建的病毒穗蛋白的合成版本,该团队表明,其遗传密码的具体变化 - B1.1.7变体中所见的突变 - 使病毒是细胞上传染性的两次作为更常见的菌株。

SARS-CoV-2病毒新冠肺炎是一种乙型冠状病毒。它的核糖核酸- 其遗传码 - 由一系列核苷酸(由字母A,C,G和U表示的化学结构组成)。随着病毒复制本身,此代码可能会被误传,导致错误,称为突变。冠状病毒在每年左右23个核苷酸取代具有相对适度的突变率。

特别令人担忧的是可能改变“刺突蛋白”结构的突变,这种蛋白位于病毒表面,赋予它特有的冠状形状。病毒利用这种蛋白质附着在宿主细胞表面的ACE2受体上,让它进入细胞,劫持细胞的机制,让它复制并扩散到全身。目前使用或正在试验的大多数疫苗都是针对刺突蛋白的,人们担心突变可能会影响这些疫苗的有效性。

剑桥LED Covid-19基因组学英国(COG-UK)联盟的英国研究人员已经确定了病毒的特定变体,包括似乎使其更传染的重要变化:ΔH69/ΔV70氨基spike蛋白的部分缺失是该变体的关键变化之一。

虽然δ h69 / δ v70缺失已经被检测过多次,但直到现在,科学家们还没有看到它们在个体中出现。然而,在今天发表在《自然》杂志上的一项研究中,剑桥大学研究人员记录了这些突变是如何出现在阿登布鲁克医院(剑桥大学医院NHS基金会信托的一部分)的一名COVID-19患者身上的。

患者为一名70多岁的男性,之前被诊断为边缘性B细胞淋巴瘤,最近接受了化疗,这意味着他的免疫系统严重受损。入院后,患者接受了一系列治疗,包括抗病毒药物瑞德西韦和恢复期血浆——即含有从已成功清除体内病毒的患者血液中提取的抗体的血浆。尽管他的病情起初稳定下来,但后来开始恶化。他被送进了重症监护室并接受了进一步治疗,但后来去世了。

在患者的住宿期间,23个病毒样品可用于分析,鼻子和喉咙的大多数。这些被称为COG-UK的一部分。研究人员观察到病毒的基因组突变是在这些序列中。

在第66天和82天之间,在康复血清的前两项助攻后,该团队观察到病毒群体的显着变化,含有ΔH69/ΔV70缺失,以及称为D796H的尖峰蛋白中的突变,成为显性。虽然这种变体最初似乎死于,但是当施用第三次雷代雷维尔和临时血浆治疗时,它再次重新出现。

剑桥治疗免疫学和传染病研究所的拉维·古普塔教授领导了这项研究,他说:“我们看到的本质上是病毒不同变种之间的竞争,我们认为这是由恢复期血浆疗法推动的。”

“最终赢得的病毒 - 具有D796H突变和ΔH69/ΔV70缺失 - 最初在临床血浆治疗期间最初获得占脑疗法,然后在恢复治疗时重新出现。其中一个突变是在新的英国变体中,尽管没有建议我们的患者是他们第一次出现的地方。“

在严格控制的条件下,研究人员创造并测试了具有单独和一起的ΔH69/ΔV70缺失和D796H突变的综合版病毒。组合突变使病毒对颠膜等离子体的中和敏感,但似乎单独的D796H突变似乎对血浆中抗体的敏感性降低负责。单独的D796H突变导致在没有血浆的情况下感染的丧失,典型的病毒获取以逃避免疫压力。

研究人员发现,ΔH69/ΔV70本身缺失使病毒是预先优势变体的传染性的两倍。研究人员认为,由于D796H突变,删除的作用是弥补传染病的丧失。该范例是病毒的经典,由此逃逸突变之后是由补偿突变伴随。

古普塔教授补充说:“鉴于疫苗和疗法都是针对刺突蛋白的,而我们在患者身上看到了这种蛋白的突变,我们的研究提出了一种令人担忧的可能性,即病毒可能会突变,从而战胜我们的疫苗。”

“由于更好的免疫控制,病毒多样性可能降低病毒多样性,这种效果不太可能发生这种效果。但它突出了治疗免疫功能性患者时需要服用的护理,其中可能发生延长的病毒复制,为病毒变得更大的机会。“

Reference: “SARS-CoV-2 evolution during treatment of chronic infection” by Steven A. Kemp, Dami A. Collier, Rawlings P. Datir, Isabella A. T. M. Ferreira, Salma Gayed, Aminu Jahun, Myra Hosmillo, Chloe Rees-Spear, Petra Mlcochova, Ines Ushiro Lumb, David J. Roberts, Anita Chandra, Nigel Temperton, The CITIID-NIHR BioResource COVID-19 Collaboration, The COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium, Katherine Sharrocks, Elizabeth Blane, Yorgo Modis, Kendra Leigh, John Briggs, Marit van Gils, Kenneth G. C. Smith, John R. Bradley, Chris Smith, Rainer Doffinger, Lourdes Ceron-Gutierrez, Gabriela Barcenas-Morales, David D. Pollock, Richard A. Goldstein, Anna Smielewska, Jordan P. Skittrall, Theodore Gouliouris, Ian G. Goodfellow, Effrossyni Gkrania-Klotsas, Christopher J. R. Illingworth, Laura E. McCoy and Ravindra K. Gupta, 5 February 2021,性质
DOI:10.1038 / s41586-021-03291-y

该研究基本上受到威克,医学研究委员会,国家卫生研究所和比尔和梅林达盖茨基金会的支持。

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