来自病毒的意外的遗传物质片段发现我们的DNA潜伏

黑暗DNA双螺旋

人类基因组病毒衍生序列中的意外多样性

强大的遗传分析工具表明,人们表现出令人惊讶的病毒衍生遗传序列变异水平。

三位riken遗传学家发现了从我们的病毒中的遗传物质遗传物质的未检测到的片段。脱氧核糖核酸。它们为该发现开发的方法对于确定此类病毒遗传物质进入人类基因组的方法,以及是否会导致个体之间的差异。

人疱疹病毒6.

图1:伪色的电子显微照片,显示人疱疹病毒6(HHV6;红色圆圈)感染细胞。RIKEN研究人员发现了从人类基因组中衍生自HHV6的新遗传结构变体。信用:©Callista图片/ Cultura / Science Library

大约8%的人类基因组可以被追溯到逆转录病毒 - 病毒,逆转遗传转录的正常顺序,具有RNA.基因组被反转转录成DNA,然后插入宿主细胞的基因组中。最臭名昭着的逆转录病毒是人类免疫缺陷病毒(HIV)。

虽然逆转录病毒可以对人类健康产生破坏性影响,但在我们的基因组中插入的病毒遗传物质可以提供有用的功能。例如,在胎盘中表达的逆转录病毒蛋白使人类和其他哺乳动物能够生育过时的后代而不是鸡蛋。

“在人类演变过程中,我们的祖先获得了许多病毒衍生的序列,其中一些病毒衍生的序列赋予了有用的职能,”瑞克综合医学科学(IMS)的Shohei Kojima说。“我曾经认为病毒是威胁,但他们的一些遗传序列对人类发展至关重要。”

在过去的二十年中,研究人员对人类基因组中的逆转录病毒遗传序列以及衍生自非逆转录病毒的病毒来源序列已经发现了很多。但目前尚不清楚这些序列在人之间变化,并且变异是否可能产生不同的人类特征。

Shohei Kojima

Shohei Kojima和两个riken同事在人类内源性病毒中发现了一个令人惊讶的人之间的变化。信用:©2021 riken

现在,Kojima,Anselmo Kamada和Nicholas Parrish都在Riken IMS,使用专门为任务专为任务专为的生物信息工具调查了来自不同人群的3,332人的病毒衍生的变化。

他们发现病毒负责人类基因组的意外结构变化。他们还发现种系中的罕见变体,可以追溯到人疱疹病毒6(图1)。

并非他们发现的所有病毒遗传物质都有古代起源。三重奏发现一些常用的细胞系已被病毒感染。“我们认为这些序列可能是由对人类遗传研究献血的受试者感染的序列可能引起的,”Parrish说。“奇怪的是,病毒通常不感染B细胞,用于制作我们使用的细胞系,因此我们并不完全了解这些病毒如何感染细胞。”

该团队打算探讨他们所识别的序列的可能功能。有些研究建议病毒遗传序列之间的关联和某些疾病的风险较高,归属票据。“如果这是真的,他们如何以及为什么他们在人口中保持?”他问。“除了成本外,我们还想看看它们是否提供了一些益处。”

参考:Shohei Kojima,Anselmo Jiro Kamada和Nicholas F. Parrish,4月26日,Shohei Kojima,Anselmo Jirima和Divere人类基因组的变异“。Plos Genetics.
DOI:10.1371 / journal.pgen1009324

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